Nyon Waves est la deuxième équipe du NTBC. Originellement composée de juniors, la première apparition officielle de l'équipe se fait durant la saison 2009-2010 lors de sa participation au championnat M18. L'équipe s'appelait alors Piranyon M18. La saison suivante, le club inscrit l'équipe en championnat régulier; c'est Piranyon 2 qui fait son entrée en ligue B. En 2011, l'équipe prend le nom de Piranyon Finz, survole la ligue B et termine la saison en beauté par une promotion en ligue A. La saison 2012-2013 est difficile, l'équipe redescend en ligue B et plusieurs joueurs intègrent la première équipe. Depuis son retour en deuxième ligue, l'équipe prend le nom de Piranyon Fusion. À partir de 2016-2017, le NTBC ne compte plus qu'une équipe de championnat. Mais en 2020-2021, une deuxième garde du club se crée à nouveau: Nyon Novio. En 2024-2025, cette équipe est renommée Nyon Waves et joue le championnat régional genevois.